基因组关联分析中的交互作用研究

项目名称： 基因组关联分析中的交互作用研究

项目编号： No.10971210

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 数理科学和化学

项目作者： 杨亚宁

作者单位： 中国科学技术大学

项目金额： 24万元

中文摘要： 复杂疾病与多个基因和环境因素以及它们之间的交互作用有关，本项目旨在研究复杂疾病全基因组关联分析中的交互作用。基因组数据的复杂性及其交互作用分析的特点导致了传统统计方法在全基因组应用上的局限性，因此发展可行且有效的交互作用分析技术是复杂疾病关联分析中亟待解决的重要课题。本项目通过借鉴机器学习工具研究基因交互作用的统计分析。我们提出的条件化搜索方法将赋予交互作用一个清晰的刻画并给出有效的统计推断方法。我们通过研究机器学习中的组合划分、回归分类树、多基因降维等多种技术降低问题复杂度，从而得到高效的检验。所提方法既注重计算上的高效性也注重操作上的易用性，能够适用于高通量的全基因组数据的分析。另外，多重检验问题、群体分层、基因型测量误差等一系列与交互作用相关的问题也在我们的研究范围中。本项目既有重要的生物医学实际背景，也有统计理论和方法上的创新性，可引发一系列后续研究。

中文关键词： 全基因组关联分析；交互作用；机器学习；统计分析；

英文摘要：

英文关键词： Association analysis；Interaction；Machine learning；Statistical analysis；