基于SNP交互作用网络高可信度预测分析的数学模型建立与评估研究

项目名称： 基于SNP交互作用网络高可信度预测分析的数学模型建立与评估研究

项目编号： No.30901242

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 轻工业、手工业

项目作者： 伍亚舟

作者单位： 中国人民解放军第三军医大学

项目金额： 19万元

中文摘要： 更精确、更系统地掌握多基因复杂疾病的发生、发展机制是现代遗传流行病学最重要的前沿研究内容；心脑血管疾病和肿瘤等多基因复杂疾病，受到多个基因位点及环境因素的影响，它们（或这些因素）之间存在着复杂的高阶交互作用；如何对影响复杂疾病的多个SNP位点产生的交互作用进行有效的处理与分析，是当前遗传流行病学和生物信息学面临的重大课题。本项目针对当前多基因复杂疾病易感性研究主要采用传统参数统计分析方法存在的不足，具体通过对现有的结直肠癌遗传易感SNP数据的分析处理，提出采用多因子降维法（MDR）结合BP神经网络(BP-NN)技术对受到多个SNP位点交互作用的多基因复杂疾病进行数学模型化处理研究，并用BP-NN、支持向量机（SVM）和非线性回归等方法对复杂发病的风险进行预测分析与综合评价，以建立适合于多基因复杂疾病的高可信度风险预测分析技术体系；对表观遗传学和生物信息学的研究与发展也有十分重要的促进作用。

中文关键词： 交互作用；多基因复杂疾病；多因子降维；叉生分析；神经网络

英文摘要：

英文关键词： Interaction；Polygenic complicated diseases；MDR；Crossover analysis；Neural network