复杂疾病基因与环境互作模型分析方法研究

项目名称： 复杂疾病基因与环境互作模型分析方法研究

项目编号： No.31371336

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 生物科学

项目作者： 崔跃华

作者单位： 山西医科大学

项目金额： 70万元

中文摘要： 复杂疾病源于遗传变异，但其发展却受环境的影响与调控，并取决于遗传变异对环境改变的敏感程度。目前基因与环境的交互作用多用一般线性模型来预测，由于基因对环境刺激的反应不一定都遵循线性变化，线性模型的应用有一定的局限性，且易致假阴性。本项目提出非线性基因与环境互作模型，基于群体关联分析原理，将变系数模型拓展到基因-环境互作研究，以解决目前基因-环境互作方法中对模型假设性过强、及可解释性和可预测性偏离实际问题等不足。项目拟通过非参数理论，模拟证实变系数模型原理，完成便于推广应用的相关软件；针对基因组或疾病通路内高维SNP数据，提出基于惩罚估计理论的高维互作处理技术，使结论更稳健于互作的生物学原理；并通过2型糖尿病等三份SNP数据和大型计算模拟，拟合非线性变系数模型，对其有效性和实用性进行评价，为复杂疾病的发病机制研究、基因诊断和预防提供研究工具与方法，在统计技术和实际应用上获得双赢。

中文关键词： 变系数模型；基因与环境互作；关联分析；高维遗传变量筛选；复杂疾病

英文摘要： Complex diseases root in genetics, but are influenced by environmental factors. The degree of influcence largely depends on how sensitive genetic factors respond to environmental stimuli. Currently many gene-environment (G×E) interaction methods are based

英文关键词： Varying-coefficient model；Gene-enviroment interaction；Association analysis；High-dimensional genetic variable selection；complex disease