原生生物miRNA的系统鉴定与起源分析

项目名称： 原生生物miRNA的系统鉴定与起源分析

项目编号： No.31401975

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 生物科学

项目作者： 郑凌伶

作者单位： 中山大学

项目金额： 25万元

中文摘要： miRNA（microRNA）是一种真核生物特有的小非编码RNA，在转录后水平行使重要的调控功能，然而miRNA的起源问题一直没有解决。原生生物是最原始的真核生物类群，其中蕴含着丰富的基因资源，但原生生物界中关于miRNA的研究存在矛盾和争议。我们先前研究发现，原生生物的miRNA与高等生物在特征上存在较大差异，不能采用高等动、植物中miRNA的标准进行研究。因此，我们总结了原生生物miRNA的三大特征，并根据这些特征设计了专门的计算机识别软件。在此基础上，本项目选取了一批代表性原生生物，采用高通量测序技术获得它们的小RNA转录组数据，选取合适的模型参数进行miRNA基因预测、表达分析、功能分析，最终获得这些miRNA之间的进化关系。本项目为研究原生生物非编码小RNA提供有力工具，为最终解决miRNA的起源与进化问题提供证据。

中文关键词： 微小RNA；小干扰RNA；高通量测序；tRNA衍的小RNA；数据库

英文摘要： MiRNA(MicroRNA) is a type of eukaryote-specific small non-coding RNA which play important regulatory role in the post-transcriptional level, the origin and evolution problem is a long-standing mystery in miRNA study. The protists is the most original euka

英文关键词： microRNA；siRNA；High Throughput Sequencing；tRNA derived small RNA；Database