基于结构模型的miRNA协同作用模式数据挖掘研究

项目名称： 基于结构模型的miRNA协同作用模式数据挖掘研究

项目编号： No.61363025

项目类型： 地区科学基金项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 自动化技术、计算机技术

项目作者： 陈庆锋

作者单位： 广西大学

项目金额： 43万元

中文摘要： 近年非编码小RNA研究引起了生物学家的关注，miRNA被发现在基因表达，修饰，转录和翻译有重要的功能调控作用。随着先进的高通量技术的应用，已完成多个模式生物的基因组深度测序。这些数据揭示了生理生化变化的遗传基础，而且为重要基因的功能验证提供了宝贵的资源。利用先进的功能基因学手段发现miRNA之间的协同作用模式，要求促进现代生物技术与计算机科学，信息技术的结合。传统数据挖掘方法在处理复杂高维的生物数据表现不足，此外，协同作用模式蕴含重要的生物信息，但缺乏相应的识别技术。如何基于已有的数据建立有效的模型，提高miRNA预测的准确性和效率，从序列和结构特征对miRNA协同调控网络进行更深层次的研究，是今后的研究重点。该项目将研究miRNAs数据采集，整合，建模，模型加工及协同调控模式挖掘的相关技术、方法和策略，包括剪切位点和剪切酶之间存在的关系，不同位点之间的关联性，miRNA的交互关系。

中文关键词： 数据挖掘；协同作用；模型；相似性；结构

英文摘要： In recent years, the study of non-coding small RNA has attracted increasing attentions of biologists. MiRNA has been found to play an important role in gene expression, editing, transcription and translation regarding varied regulation funtions. With the

英文关键词： data mining；synergistic pattern；model；similarity；structure