新一代高通量DNA测序技术在肿瘤miRNA/mRNA差异表达分析中的应用方法研究

项目名称： 新一代高通量DNA测序技术在肿瘤miRNA/mRNA差异表达分析中的应用方法研究

项目编号： No.60971021

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 自动化技术、计算机技术

项目作者： 白云飞

作者单位： 东南大学

项目金额： 33万元

中文摘要： miRNAs和mRNA共同构成了一个重要的基因调控网络，在动物发育、细胞分化及代谢中起着重要的作用。近期的研究表明它们还与肿瘤的发生有着极其重要的关联。了解miRNAs与mRNA之间在正常组织和肿瘤组织中表达差异的密切关系将在癌症的发生、诊断和治疗中带给我们一些重要线索。本项目利用新一代高通量测序仪，发展一种多样本测序文库构建方法，结合我们已有的生物信息学分析平台，对4种不同肿瘤样本及正常样本的miRNA 和mRNA同时进行全基因组范围的表达差异分析，利用传统的荧光定量PCR方法进行验证，试图更全面地寻找与肿瘤发生相关的新的miRNA，用以阐明miRNA在调节各种基因的表达水平与肿瘤发生的关系，筛选特定miRNA作为肿瘤的早期诊断标志物、恶性评估及预后的判断指标等，并可以用于筛选能够控制瘤生长的生物小分子药物。本课题研究在肿瘤分子生物学、功能基因组学及生物医药领域具有广泛的应用。

中文关键词： 新一代DNA测序技术；miRNA表达谱；mRNA表达谱；肿瘤；关联分析

英文摘要：

英文关键词： new generation DNA sequencing；miRNA expression；mRNA expression；cancer；associated analysis