整合猪miRNA和功能基因表达谱芯片元数据挖掘肌肉生长发育新的调控通路

项目名称： 整合猪miRNA和功能基因表达谱芯片元数据挖掘肌肉生长发育新的调控通路

项目编号： No.30900792

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 轻工业、手工业

项目作者： 曹建华

作者单位： 华中农业大学

项目金额： 21万元

中文摘要： 在本室前期研究所获得的猪肌肉miRNA和功能基因表达谱cDNA芯片元数据的基础上，采用基于系统进化分析和R&Bioconductor的生物信息学研究平台，通过miRNA和功能基因表达谱联合分析，从基因转录和转录后调控两个水平挖掘miRNA调控猪肌肉生长发育新的关键基因集，构建miRNA的调控通路模型，建立miRNA家族表达模式与肌肉生长发育相关基因集之间的内在联系，从功能基因表达调控的系统生物学层面上研究猪肌肉生长发育的重要特征，并通过细胞功能实验验证miRNA介导的调控通路。以期初步阐明miRNA调控猪肌肉生长发育相关通路的基本规律，探索猪肌肉生长发育的时空特性，解析miRNA介导猪肌肉生长发育调控通路的生物学效应。为进一步研究miRNA与肌肉生长发育之间精细的调控机制奠定基础，从而为深入研究猪肌肉生长发育的调控通路和发育模式提供理论支持。

中文关键词： 猪；肌肉生长发育；miRNA；基因芯片；数据挖掘

英文摘要：

英文关键词： porcine；muscle development；miRNA；gene chip；data mining