通过全基因组关联分析发掘水稻磷高效利用相关位点及基因

项目名称： 通过全基因组关联分析发掘水稻磷高效利用相关位点及基因

项目编号： No.31401939

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 农业科学

项目作者： 严明

作者单位： 上海市农业生物基因中心

项目金额： 23万元

中文摘要： 水稻是我国主要的粮食作物。培育优质高产抗病抗逆营养高效的绿色超级稻已成为现代水稻育种的重要方向，我国是磷矿资源严重不足的国家，且水稻磷肥当季利用率低，易造成环境污染和资源浪费。因此有必要利用水稻基因组研究的新技术和新方法，发掘水稻种质资源中磷高效相关位点及基因。本项目基于已完成304份遗传多样性高的水稻材料全基因组重测序并获得约102万个SNP位点的基因型数据。在三种磷水平处理下两年多重复田间试验中，测定水稻的分蘖数、株高、叶绿素含量、植株磷含量以及产量等表型特征；通过营养液培养在低磷和正常供磷条件下测定水稻植株磷含量、根系有机酸分泌量、酸性磷酸酶活性等生理生化特性。完成上述各性状的全基因组关联分析，针对显著关联位点和已知磷吸收利用相关基因等信息，开展局部的精细关联定位，发掘有利等位基因或者单元型。配制磷高效品种与高产恢复系等材料，杂交回交，培育具有育种应用价值的磷高效水稻品系。

中文关键词： 全基因组关联分析；单核苷酸多态性；磷高效利用；；

英文摘要： Rice is the main food in our country. Modern rice breeding is now developing with disease resistant, stress tolerant, nutrient use efficient and highly productive green super rice cultivation. Phosphorite resources in China are serious shortage and the lo

英文关键词： Genome-wide association study；Single nucletide polymorphism；High phosphorus use efficiency；；