结合连锁和关联分析剖析玉米籽粒类黄酮含量的遗传基础

项目名称： 结合连锁和关联分析剖析玉米籽粒类黄酮含量的遗传基础

项目编号： No.31201220

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 食品科学、农学基础与作物学

项目作者： 闻玮玮

作者单位： 华中农业大学

项目金额： 24万元

中文摘要： 类黄酮是植物最重要的次级代谢产物之一。研究玉米种子中的类黄酮代谢途径及其调控，并阐明其遗传学机制，以及利用遗传改良提高玉米中具有重要生物功能和生理活性的类黄酮物质的含量，对玉米本身的生长发育、增加其营养和饲料产品的附加值等都具有极其重要的意义。连锁分析和关联分析是研究复杂性状表型变异遗传基础的主要方法。本研究拟对一套具有广泛多样性的玉米自交系关联分析大群体和两套重组自交系群体进行基于两年两点的籽粒类黄酮鉴定及其含量的测定，进行基于全基因组高密度SNP 的基因型分析，结合连锁定位和关联分析的策略，在全基因组水平上扫描控制玉米籽粒类黄酮生物合成与代谢相关的位点，剖析其遗传结构，发掘新的基因；在此基础上，对检测到的主效 QTL，通过关联分析寻找、验证候选基因，挖掘有利等位基因，为玉米品质的分子育种提供基因资源。

中文关键词： 玉米；类黄酮；连锁分析；关联分析；

英文摘要： Flavonoids are important secondary metabolites in plants, which are crucial to the plant development and stress tolerance, and also benefical to human health. This project plans to characterize a large association population and two RIL populations of maize by using high-density genome-wide SNP markers, and measure flavonoid content in maize kernels of them in multiple environments in order to dissect the genetic basis of flavonoid content in maize kernel using a joint linkage-association approach. Based on the detected major QTL, potential candidate genes will be selected taking advantage of transcriptomic and bioinformatic analysis. Favorable alleles will be defined after evaluating gene function and estimating their genetic effects, which provide beneficial gene resources and lay a foundation for molecular breeding on maize grain quality.

英文关键词： maize；flavonoid；linkage analysis；association analysis；