拟南芥叶绿体蛋白翻译后修饰图谱的初步构建及功能网络分析

项目名称： 拟南芥叶绿体蛋白翻译后修饰图谱的初步构建及功能网络分析

项目编号： No.31171264

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 生物科学

项目作者： 石铁流

作者单位： 华东师范大学

项目金额： 60万元

中文摘要： 叶绿体是植物细胞中与光合作用直接相关的细胞器，也是淀粉、脂肪酸、叶绿素、胡萝卜素、嘌呤、嘧啶及大部分氨基酸的合成场所。叶绿体含有大量的蛋白质，可占整个植物组织蛋白质的10％-25％。我们的前期工作通过多维液相色谱质谱联用技术在野生型和突变体（clpr4）拟南芥叶绿体中共鉴定到1786个叶绿体蛋白，其中包括实验尚未报道的新蛋白496个。初步分析发现有1224个蛋白含有1种或一种以上的蛋白修饰位点。本项目拟以质谱技术产生的这些拟南芥叶绿体蛋白质的检测数据为基础，优化蛋白修饰鉴定算法和计算流程，对拟南芥整体叶绿体蛋白质组进行蛋白组分鉴定以及相应的翻译后修饰注释工作，初步注释完成叶绿体蛋白对应的翻译后修饰类型以及相应的修饰位点信息，并在此基础上结合转录调控以及蛋白相互作用等高通量功能组学数据，对整体叶绿体蛋白功能网络结构进行分析，以试图发现不同翻译后修饰间的功能协作关系及作用机理。

中文关键词： 拟南芥；叶绿体蛋白组；蛋白质谱；蛋白质修饰；磷酸化

英文摘要：

英文关键词： Arabidopsis；Chloroplast Proteome；Mass Spectrometry；Protein modification；Phosphorylation