基因调控网络构建及其拓扑结构分析的研究

项目名称： 基因调控网络构建及其拓扑结构分析的研究

项目编号： No.60973092

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 自动化技术、计算机技术

项目作者： 刘桂霞

作者单位： 吉林大学

项目金额： 31万元

中文摘要： 分子生物学的深入研究揭示了复杂生命现象是基因相互调控的结果，但至今尚未完全清楚基因调控的机制，为理解生物系统的内在模式和调控机制，构建与分析基因调控网络是一种有效的途径,并成为生物信息学研究的前沿和热点。本项目针对当前基因调控网络研究分析的局限，采用新的信息融合技术解决异源、异质的基因表达数据的独立性和低信息问题；提出新的聚类分析方法，解决基因表达数据的"维数灾难"，并发现调控模块；提出新的数学模型和新的优化策略实现基因调控网络的构建分析；引入复杂网络特性对基因调控网络的拓扑结构进行分析，通过网络状态描述建立网络拓扑结构与基因功能之间的映射，从而深入理解基因调控机理；研发基因调控网络重构与分析软件。本项目的研究以期实现基因调控网络的自动识别，推动系统生物学的研究发展，对于探究疑难疾病的发病机理和药物设计等具有重要的理论意义和应用价值。

中文关键词： 差异表达基因；聚类分析；基因调控网络；蛋白质复合物；pathway拓扑结构推理

英文摘要：

英文关键词： differentially expressed gene；clustering analysis；gene regulatory networks；protein complex；pathway topology inferring