基于肿瘤蛋白质突变、定量与修饰改变的信号通路网络分析及网络药物研究

项目名称： 基于肿瘤蛋白质突变、定量与修饰改变的信号通路网络分析及网络药物研究

项目编号： No.31570831

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2015

项目学科： 生物科学

项目作者： 谢鹭

作者单位： 上海生物信息技术研究中心

项目金额： 25万元

中文摘要： 肿瘤分子靶向药物的研究多集中在肿瘤相关突变位点的关联性分析上，然而基于基因组突变与蛋白质结构、表达或修饰的协同改变来发现网络药物的研究相对匮乏。本课题组在前期蛋白质组学数据分析研究中，已构建了人磷酸化介导的信号传递网络数据库，探讨了突变与蛋白质表达的协同效应，并初步发现了突变与修饰在肿瘤疾病中的相关性。本项目在此基础上，进一步针对乳腺癌开展基于蛋白质突变、表达与修饰改变的信号通路网络分析及网络药物研究。依据乳腺癌基因组测序、蛋白质质谱鉴定和磷酸化蛋白质组学数据，鉴定引起蛋白质氨基酸变异的基因突变与蛋白质表达量之间的关系以及异常磷酸化修饰与突变位点之间的关系，构建包含乳腺癌蛋白质突变、表达以及磷酸化修饰信息的蛋白质信号通路网络，计算预测网络中的驱动突变子和关键扰动模块，进行抗肿瘤联合用药的策略设计。该项目的实现将为多组学数据贯通分析提供生物信息学平台，并运用于肿瘤网络药物研究。

中文关键词： 药物预测；组学整合；癌症；组合药物；信号网络

英文摘要： Recently the research focus of tumor molecular target therapy lies mostly in the association analysis of mutation loci and tumor. However studies incorporating genomic mutation and variation in protein structure and expression and modification to discover

英文关键词： drug prediction；omics integration；cancer；combination drug；signaling network