遗传相互作用网络的构建和分析

项目名称： 遗传相互作用网络的构建和分析

项目编号： No.31171262

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 生物科学

项目作者： 邓明华

作者单位： 北京大学

项目金额： 60万元

中文摘要： 遗传相互作用也称为基因上位作用(Epstatic interaction), 它表征了基因之间的功能相关性。近年来，高通量的基因敲除和图像显示技术相结合，为定量构建遗传相互作用图谱，进行功能基因组分析提供了大量有效的数据。本项目从遗传相互作用定量实验EMAP数据出发，融合多种高通量数据对相关功能通路(Pathway)和功能模块进行预测；构建遗传相互作用网络预测模型，并将理论预测和实验验证相结合，构建全基因组的遗传相互作用网络，为进一步的功能基因组研究奠定基础。

中文关键词： EMAP实验；网络聚类；低秩矩阵分解；数据融合；上位相互作用

英文摘要：

英文关键词： EMAP Experiment；Network Clustering；low-rank matrix decomposition；Data integration；Epstasis