拟南芥综合生物信息学在线服务平台构建

项目名称： 拟南芥综合生物信息学在线服务平台构建

项目编号： No.31401133

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 生物科学

项目作者： 李鹏

作者单位： 华东师范大学

项目金额： 24万元

中文摘要： 伴随着我国植物分子生物学研究的蓬勃发展，拟南芥功能基因组学研究领域的学术成果及影响力已提升到了国际领先水平，但由于相关领域基因组注释数据库的匮乏，使得我们只能将研究成果提交到国外已有的基因组数据库，限制了我们在这一领域的长足发展，本研究计划抓住拟南芥已有基因组数据库TAIR商业化转型，广大用户数据提交和数据共享的热情大大降低这一重大机遇，以已有的拟南芥蛋白质组学综合数据库ATPID的软硬件环境为基础，利用基因芯片、新一代测序、蛋白质质谱、突变体资源等高通量数据，结合国内拟南芥研究领域宝贵的数据资源，构建一个涵盖基因功能注释、蛋白质功能预测、生物功能通路注释和突变体及种子资源索引在内的多功能综合性拟南芥在线服务平台，在为广大研究人员提供数据索引和分析工具的同时，收集最新研究成果，进一步完善拟南芥基因组注释，提升中国在基因组注释领域的核心影响力。

中文关键词： 数据库；拟南芥；蛋白质相互作用；表型；基因型

英文摘要： Genes and Genomes database for specific specie plays a central role in the supporting system for biological researchers. While offering data indexing and queering services, it also engages researchers to submit the latest published research literature and

英文关键词： Database；Arabidopsis thaliana；PPI；genotype；phenotype