癌症预后共同分子特征模块挖掘及其在线分析平台构建

项目名称： 癌症预后共同分子特征模块挖掘及其在线分析平台构建

项目编号： No.31401140

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 生物科学

项目作者： 洪胜君

作者单位： 中国科学院上海生命科学研究院

项目金额： 22万元

中文摘要： 研究癌症预后分子机制对于癌症病程进展追踪、诊断与治疗有重要意义。过去大部分研究只针对一种癌症，或只使用一类遗传数据。如此，会丢失大量遗传信息，无法有效鉴定与癌症预后有关的分子特征。 本项目整合癌症基因组项目中14种癌症的基因组、转录组、表观遗传组学和临床样本数据，从系统水平上探索癌症预后遗传机制。首先，对每一种癌症，整合其多组学数据、分类预后亚型、鉴别相关分子特征模块。其次，通过网络比较方法，挖掘多种癌症预后相关的共同分子特征模块和每种癌症特有的分子模块。再次，对挖掘到的分子模块进行数据集和初步实验验证。最后，开发挖掘共同分子特征模块的在线分析平台。 本项目首次从系统水平上、利用高通量异质数据提供的遗传变异信息来研究癌症预后分子机制的共同性和异质性。预后有关的分子特征模块既能为癌症预后亚型分类提供更精确的分子标签，也可为抗癌药物的研发提供新的候选靶基因或位点。

中文关键词： 癌症；预后；共同模块；网络分析；炎症

英文摘要： Understanding molecular mechanism of cancer prognosis can help in its diagnosis and treatment. Most studies only focus on one tumor type or feature category. However, such strategy will overlook comprehensive genetic information underlying cancer and cann

英文关键词： cancer；prognosis；common module；network analysis；inflammation