建立针对肝炎、肝癌研究的多组学数据库及数据分析平台

项目名称： 建立针对肝炎、肝癌研究的多组学数据库及数据分析平台

项目编号： No.91329302

项目类型： 重大研究计划

立项/批准年度： 2013

项目学科： 生物科学

项目作者： 韩敬东

作者单位： 中国科学院上海生命科学研究院

项目金额： 300万元

中文摘要： 人类癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)汇集了包括染色体片段拷贝数变异、mRNA和miRNA表达谱、基因序列突变、DNA甲基化、单核苷酸多态性等多种肿瘤组织的遗传物质信息，极大地促进了癌症组学数据的整合、癌症亚型分类、药物分子靶标鉴定和小分子相互作用网络等相关研究。但令人遗憾的是，作为亚洲人群高发的癌症，原发性肝癌（以下简称肝癌）没有被列入TCGA的研究计划。由我国自主资助的研究项目已经产生了肝癌的基因组、功能基因组和蛋白质组数据,在本项目中，我们将发挥在多组学数据整合、分子分型、分子标记发掘、基因调控网络预测及分析方面的特长，充分利用包括这些组学数据在内的公共数据和已发表的相关数据，建立针对肝炎、肝癌的基因组、功能基因组、表观遗传组和蛋白质组数据库，为用户提供可视化的与肝炎、肝癌研究相关的多组学数据分析软件和网络分析平台。

中文关键词： 炎症；癌症；炎癌转移；调控网络；炎癌数据库

英文摘要： The Cancer Genome Atlas (TCGA) consists of genetic information of a variety of carcinoma tissues , including chromosomal segment copy number variation, mRNA and miRNA expression profile, gene mutation, DNA methylation and single nucleotide polymorphisms,w

英文关键词： inflammation；cancer；nflammation to cancer transition；regulation network；inflammation to cancer database