项目名称: SNPs数据筛查的计算机理与参数计算方法
项目编号: No.60970095
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2010
项目学科: 自动化技术、计算机技术
项目作者: 张祖平
作者单位: 中南大学
项目金额: 30万元
中文摘要: 单核苷酸多态(SNPs)数据筛查已成为功能基因组研究领域的核心科学问题之一,然而海量数据与复杂关联使问题难以有效求解;参数计算方法是求解难解问题非常有效的手段,引进到SNP数据筛查中,可望出现新的转机。 面向多癌家系SNPs数据基于特征的筛选及鼻咽癌相关SNPs筛查等实际分子生物计算问题,揭示多约束海量SNPs数据筛查的计算机理,引进参数计算方法,建立参数可解性计算模型;通过深入分析问题的参数计算复杂性,提出实际有效的参数算法分析与设计技术及统一的优化方法,并提出面向实际问题的快速求解方法与计算平台。 项目将为求解SNPs数据筛查问题提供有效的理论与技术,为问题的快速计算响应提供手段与方法。将为研究生物计算中的相关问题提供典型应用示范,为同类问题提供强有力的技术支撑,推动生物计算的快速发展,为参数计算与生物计算建立联系的纽带,同时,实际有效的参数计算方法将推动参数计算本身的发展。
中文关键词: 参数计算;生物计算;SNPs 数据筛查;参数可解性;算法分析与设计
英文摘要:
英文关键词: parameter computing;biology computing;SNPs data screening;parameter solvability;algorithm analysis and design