项目名称: 儿童急性淋巴细胞白血病发病和复发关联的遗传变异在基因组水平上作用机制的研究
项目编号: No.81400120
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2014
项目学科: 医药、卫生
项目作者: 许恒
作者单位: 四川大学
项目金额: 23万元
中文摘要: 儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)是儿童中最常见的肿瘤,我们已通过全基因组关联分析(GWAS)发现了位于ARID5B等基因中的单核苷酸多态性位点(SNP)与ALL发病相关联。研究发现GWAS定位的SNP通常经基因组连锁不平衡性(LD)标记致病变异,定位致病变异即成为后GWAS 时代的重要研究方向。最新的报道和我们前期工作提示ALL易感基因的致病变异可能通过改变表观遗传学特性影响ALL的易感性。本课题利用最新的基因组和表观遗传信息数据库通过生物信息学分析寻找GWAS位点所在的重要表观遗传区域及其中的SNP,结合进一步的分子生物学和细胞生物学实验确定潜在的致病相关表观遗传功能域,并在其中筛选能改变区域内表观遗传特性的SNP作为候选的致病变异。通过结合生物信息学和实验生物学寻找ALL的致病变异不但对ALL的预防和治疗具有重要的指导意义,也为其他疾病的后GWAS研究提供新的思路。
中文关键词: 全基因组关联分析;单核苷酸多态性;急性淋巴细胞白血病;生物信息分析;调控网络
英文摘要: Acute lymphoblastic leukemia is (ALL) is the most common cancer in children. A genetic basis of ALL susceptibility is supported by genome-wide association studies (GWAS) identifying single nucleotide polymorphisms (SNPs) at ARID5B etc, which may tag the c
英文关键词: genome-wide association study;single nucleotide polymorphism;acute lymphoblastic leukemia;bioinformatics analysis;regulatory network