Remotely sensed data are dominated by mixed Land Use and Land Cover (LULC) types. Spectral unmixing is a technique to extract information from mixed pixels into their constituent LULC types and corresponding abundance fractions. Traditionally, solving this task has relied on either classical methods that require prior knowledge of endmembers or machine learning methods that avoid explicit endmembers calculation, also known as blind spectral unmixing (BSU). Most BSU studies based on Deep Learning (DL) focus on one time-step hyperspectral or multispectral data. To our knowledge, here we provide the first study on BSU of LULC classes using MODIS multispectral time series, in presence of missing data, with end-to-end DL models. We further boost the performance of a Long-Short Term Memory (LSTM)-based model by incorporating geographic plus topographic (geo-topographic) and climatic ancillary information. Our experiments show that combining spectral-temporal input data together with geo-topographic and climatic information substantially improves the abundance estimation of LULC classes in mixed pixels. To carry out this study, we built a new labeled dataset of the region of Andalusia (Spain) with monthly multispectral time series of pixels for the year 2013 from MODIS at 460m resolution, for two hierarchical levels of LULC classes, named Andalusia MultiSpectral MultiTemporal Unmixing (Andalusia-MSMTU). This dataset provides, at the pixel level, a multispectral time series plus ancillary information annotated with the abundance of each LULC class inside each pixel. The dataset (https://zenodo.org/record/7752348##.ZBmkkezMLdo) and code (https://github.com/jrodriguezortega/MSMTU) are available to the public.


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