Deep neural network ensembles combine the wisdom of multiple deep neural networks to improve the generalizability and robustness over individual networks. It has gained increasing popularity to study deep ensemble techniques in the deep learning community. Some mission-critical applications utilize a large number of deep neural networks to form deep ensembles to achieve desired accuracy and resilience, which introduces high time and space costs for ensemble execution. However, it still remains a critical challenge whether a small subset of the entire deep ensemble can achieve the same or better generalizability and how to effectively identify these small deep ensembles for improving the space and time efficiency of ensemble execution. This paper presents a novel deep ensemble pruning approach, which can efficiently identify smaller deep ensembles and provide higher ensemble accuracy than the entire deep ensemble of a large number of member networks. Our hierarchical ensemble pruning approach (HQ) leverages three novel ensemble pruning techniques. First, we show that the focal diversity metrics can accurately capture the complementary capacity of the member networks of an ensemble, which can guide ensemble pruning. Second, we design a focal diversity based hierarchical pruning approach, which will iteratively find high quality deep ensembles with low cost and high accuracy. Third, we develop a focal diversity consensus method to integrate multiple focal diversity metrics to refine ensemble pruning results, where smaller deep ensembles can be effectively identified to offer high accuracy, high robustness and high efficiency. Evaluated using popular benchmark datasets, we demonstrate that the proposed hierarchical ensemble pruning approach can effectively identify high quality deep ensembles with better generalizability while being more time and space efficient in ensemble decision making.


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