项目名称: 蛋白茶多酚复合物的分子模拟和小角X光散射研究
项目编号: No.21374117
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2013
项目学科: 数理科学和化学
项目作者: 李云琦
作者单位: 中国科学院长春应用化学研究所
项目金额: 82万元
中文摘要: 借助Monte Carlo (MC)和Molecular Dynamics (MD)分子模拟方法、小角X光散射(SAXS)结合生物信息学等多学科交叉方法,建立血清蛋白、血红蛋白与茶多酚的粗粒化模型、全原子模型及其对应的能量势场;研究蛋白质与茶多酚相互作用形成复合物过程中的关键结合位点、结合强度、蛋白结构变化和茶多酚桥连作用下的大分子聚集行为;明晰蛋白茶多酚复合物的作用机制、分散模式以及对诸如不同茶多酚的化学计量、化学结构和体系的离子强度等环境变量的响应性;将蛋白茶多酚复合物及其聚集体结构的模拟结果与从相应复合物体系利用SAXS获得的散射图案进行比较,定量评估并优化分子模拟的能量势场,以期推广该研究方法到其它类似蛋白质复合物体系的研究;考察血清蛋白、血红蛋白与茶多酚的竞争或协同作用模式,为理解蛋白茶多酚复合物参与的重要生物物理过程提供清晰的科学阐述。
中文关键词: 蛋白质复合物;结构;相互作用;计算机模拟;小角散射
英文摘要: Protein and polyphenol both are important biopolymers to our body. Their complex attracted intensive interests in recent years due to the versatile bioactivities, such as antioxidant, anticarcinogenic, anti-aging and anti-inflammatory etc. This applicatio
英文关键词: protein complex;structure;interaction and affinity;computer simulation;small angle scattering