蛋白质折叠和功能性变构机理的理论研究

项目名称： 蛋白质折叠和功能性变构机理的理论研究

项目编号： No.10947014

项目类型： 专项基金项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 金属学与金属工艺

项目作者： 苏计国

作者单位： 燕山大学

项目金额： 14万元

中文摘要： 蛋白质天然结构及其所固有的动力学特性对蛋白质折叠和蛋白质功能性变构具有重要作用。本项目在传统弹性网络模型基础上，考虑蛋白质序列信息、残基侧链信息、残基间相互作用特异性、溶剂效应等，发展有效分析蛋白质结构柔性的理论模型。在此基础上，结合正则模分析、朗之万动力学、蒙特卡罗模拟，以及全原子动力学模拟等手段，从动力学的角度，考察蛋白质天然结构的柔性，建立能够有效刻画残基在蛋白质局部和整体结构中柔性的物理参量，探讨蛋白质结构柔性与蛋白质折叠/去折叠事件的次序之间的内在联系，通过对蛋白质柔性分析来识别折叠核和功能位点，为揭示蛋白质折叠机理提供有益探索。并通过对蛋白质天然结构动力学特性的分析，研究蛋白质变构的微观机制，通过对残基运动的协同性分析，识别蛋白质变构过程中的重要残基，从残基水平上，揭示蛋白质内部信号传递的机制，为进一步理解蛋白质结构－功能关系提供有益探索。

中文关键词： 蛋白质折叠；变构；拓扑结构；动力学性质；弹性网络模型

英文摘要：

英文关键词： protein folding；allostery；topology；dynamical properties；elastic network model