项目名称: 沙田柚配子体自交不亲和性的分子机理研究
项目编号: No.31360477
项目类型: 地区科学基金项目
立项/批准年度: 2013
项目学科: 农业科学
项目作者: 秦新民
作者单位: 广西师范大学
项目金额: 48万元
中文摘要: 以沙田柚自交和异交授粉后1~3天的花柱为材料,提取其总RNA,分离出mRNA,分别构建模板文库,采用第二代测序技术对沙田柚自交和异交花柱转录组进行高通量测序。通过与Nr、Uniiprot、及CDD等公共数据库序列比对来注释自交和异交花柱中转录组测序序列,并对所测序列进行GO、COG以及KEGG等功能注释和代谢途径分析。通过比较自交和异交花柱中基因表达图谱,了解自交和异交花柱中相关基因的表达差异。同时,根据测序结果,设计特异引物,通过PCR方法克隆参与自交不亲和的主要基因。在此基础上,将自交不亲和基因转入拟南芥或烟草中进行功能鉴定。最后通过分析沙田柚自交不亲和过程相关基因表达和协同关系,探讨沙田柚配子体自交不亲和性的分子机理。
中文关键词: 沙田柚;自交不亲和性;转录组测序;miRNA测序;基因功能鉴定
英文摘要: The newly developed Solexa/Illumina RNA-sequence and DGE high-throughput deepsequencing approaches have dramatically changed how functional complexity of the transcriptome can be studied. Self-pollinated styles and cross-pollinated styles of Citrus grandi
英文关键词: Citrus grandis var. Shatinyu Hort;self–incompatibility;transcriptome sequencing;miRNA sequencing;identification of gene function