基于隐马尔科夫模型的癌症关联基因调控通道建模研究

项目名称： 基于隐马尔科夫模型的癌症关联基因调控通道建模研究

项目编号： No.30900321

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 武器工业

项目作者： 王红强

作者单位： 中国科学院合肥物质科学研究院

项目金额： 21万元

中文摘要： 本项目拟主要基于隐马尔科夫模型(HMM)建模癌症关联基因调控通道（Regulatory pathway），并在此基础上进一步研究基于基因表达谱的癌症诊断问题。首先，结合来自蛋白质组、新陈代谢组等数据的相关先验信息使用Bayesian、EM方法研究基于调控概率模型(RPM)的基因调控信息提取方法，构建基于RPM的基因评价准则；然后，在有效利用基因调控信息的基础上，研究基于独立变量群分析(IVGA)的调控通道基因子集识别方法，构建基于RPM的调控通道评价准则；接着，依据所识别的调控通道基因子集，结合调控概率模型，研究基于隐马尔可夫模型的癌症单调控通道建模方法，并基于加权集成策略研究癌症多通道调控机制、编码癌症调控特征；最后，在上述分析和建模的基础上开发基于多通道调控模型的癌症诊断软件系统。本项目的深入研究将为系统地揭示癌症本质开辟新的途径，并为个性化医学的研究与发展打下基础。

中文关键词： 癌症；基因通路；流行学习；隐马尔科夫模型；独立分量群分析

英文摘要：

英文关键词： Cancer；Gene pathways；Manifold learning；HMM；IVGA