基因表达与调控组织特异性模式发现及评价机制研究

项目名称： 基因表达与调控组织特异性模式发现及评价机制研究

项目编号： No.61170177

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 自动化技术、计算机技术

项目作者： 宫秀军

作者单位： 天津大学

项目金额： 57万元

中文摘要： 辨识和分析组织特异性基因及其调控关系对理解生物体的内在活动机制、具有针对性的疾病诊断和药物设计具有重要作用。本项目以基因表达及调控的组织特异性为研究对象，利用贝叶斯分析的方法与理论，从基因表达、序列模式及相互作用网络三个层次，综合研究组织特异性模式发现与评价算法。具体地说，研究基于约束的贝叶斯混合模型分析基因跨组织的共表达模式，通过基因集合富集分析来评价模式的有效性；集成现有的模式发现方法，发现组织特异性基因序列模式，通过贝叶斯因子分析的方法，评价目标基因序列模式的重要性；构建组织特异性基因及其转录因子与编码蛋白相互作用网络，通过网络拓扑分析方法，研究相互作用网络的特异性结构。最终，构建一个基于语义网的基因表达及其调控组织特异性综合知识库。

中文关键词： 组织特异性；显著性检验；隐马尔科夫模型；保守功能模块；MapReduce

英文摘要：

英文关键词： Tissue specificity；Significance test；Hidden Markov model；Conserved function module；MapReduce