Adaptive finite element methods are a powerful tool to obtain numerical simulation results in a reasonable time. Due to complex chemical and mechanical couplings in lithium-ion batteries, numerical simulations are very helpful to investigate promising new battery active materials such as amorphous silicon featuring a higher energy density than graphite. Based on a thermodynamically consistent continuum model with large deformation and chemo-mechanically coupled approach, we compare three different spatial adaptive refinement strategies: Kelly-, gradient recovery- and residual based error estimation. For the residual based case, the strong formulation of the residual is explicitly derived. With amorphous silicon as example material, we investigate two 3D representative host particle geometries, reduced with symmetry assumptions to a 1D unit interval and a 2D elliptical domain. Our numerical studies show that the Kelly estimator overestimates the error, whereas the gradient recovery estimator leads to lower refinement levels and a good capture of the change of the lithium flux. The residual based error estimator reveals a strong dependency on the cell error part which can be improved by a more suitable choice of constants to be more efficient. In a 2D domain, the concentration has a larger influence on the mesh distribution than the Cauchy stress.


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