项目名称: 人类干细胞中微小RNA转录调控网络的系统构建与分析
项目编号: No.60905013
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2010
项目学科: 生物科学
项目作者: 汪小我
作者单位: 清华大学
项目金额: 20万元
中文摘要: 近年来研究发现,微小RNA和表观遗传修饰在干细胞的编程与重编程过程中起到关键调控作用,成为当前生命科学领域研究的重点和热点。而深度测序等新一代高通量实验技术的出现,为我们从信息科学和系统科学的角度研究由多种复杂因素共同作用的基因表达调控过程创造了条件。本课题将整合表观遗传修饰、基因组序列和比较基因组等多方面信息,探索人类干细胞中微小RNA的转录调控规律。从系统生物学的角度研究转录因子和组蛋白修饰等各种调控因素与基因表达量之间的关系,比较这些因素在处于不同分化阶段的干细胞之间的异同,找出主要调控因子和关键调控模式,建立人类干细胞中微小RNA基因的转录调控模型和调控网络。同时,探索针对特定生物学对象复杂基因调控网络的分析方法,以及在缺乏样本标注的情况下利用生物学背景知识对海量的基因组数据开展无监督和半监督学习的方法。
中文关键词: miRNA;深度测序;调控;靶基因预测;细胞衰老
英文摘要:
英文关键词: microRNA;deep sequencing;regulation;target prediction;cellular senescence