基于高通量表观基因组图谱的癌症分子分型的系统分析

项目名称： 基于高通量表观基因组图谱的癌症分子分型的系统分析

项目编号： No.31371334

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 生物科学

项目作者： 张岩

作者单位： 哈尔滨医科大学

项目金额： 60万元

中文摘要： 肿瘤精确的分子分型可为肿瘤诊断和治疗提供有效的指导，高通量实验产生的表观基因组数据促进系统地基于表观遗传修饰的癌症分子分型及亚型特异致病机制的阐明。本课题以乳腺癌为模型，依照癌症信息数据库→表观遗传修饰的癌症分子分型→亚型特异的表观遗传调控机制分析→亚型特异的表观遗传标记物识别的研究思路，收集多种实验技术测定乳腺癌多样本的DNA甲基化、组蛋白修饰、lncRNA和基因表达谱等信息，构建综合的乳腺癌信息库，开发有限聚类算法基于表观遗传修饰分类乳腺癌亚型；应用模式识别算法系统挖掘表观遗传修饰异常介导不同亚型的分子模式，比较分析亚型表观遗传状态图谱，发现乳腺癌亚型分子诊断和靶向治疗的标志物；构建分析技术平台并将该平台推广至其他癌症的分子分型。利用课题组的生物信息学技术优势，结合生物信息学与实验研究手段，挖掘癌症亚型特异的表观基因组特征、调控机制，可提供癌症的分子分型、靶向治疗和分子机制研究新策略。

中文关键词： 生物信息学；数据挖掘；表观遗传调控；模式识别；癌症分子分型

英文摘要： Accurate molecular subtypes in tumor can provide effective guidance for tumor diagnosis and treatment. High throughput epigenomic data facilitate our systematic understanding of cancer molecular typing based on epigenetic modifications and the subtype-spe

英文关键词： bioinformatics；data mining；epigenetic regulation；pattern recognition；cancer molecular typing