EHD2相关的mRNA与miRNA在乳腺癌中的整合网络分析

项目名称： EHD2相关的mRNA与miRNA在乳腺癌中的整合网络分析

项目编号： No.81402175

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 医药、卫生

项目作者： 陈永孜

作者单位： 天津医科大学

项目金额： 23万元

中文摘要： 本实验室前期研究发现ehd2是乳腺癌特异性抑制基因，它的定位异变与患者的总生存和无病生存密切相关。本项目拟采用mRNA与miRNA芯片数据整合分析的方法建立ehd2在乳腺癌中的表达调控网络。首先，将ehd2过表达、降表达及其对照细胞系建立mRNA芯片和miRNA芯片；然后筛选出与ehd2表达相关的主要基因及主要miRNA；随后，根据miRNA与mRNA的负相关关系，找到密切相关的miRNA-mRNA对，构建miRNA-mRNA相关网络并预测miRNA的靶基因，进而建立miRNA-mRNA调控网络，从中提取miRNA-mRNA调控模块，并对其进行功能分析；最后，使用qRT-PCR对模块中miRNA及其调控的基因之间的表达关系进行实验验证，确定与ehd2有关的miRNA调控通路。该项目的实施不仅将有助于我们深入了解ehd2在乳腺癌中的调控机制，而且可以提取重要的miRNA作为乳腺癌的治疗靶点。

中文关键词： 乳腺癌；ehd2；生物信息；基因芯片；调控网络

英文摘要： Our previous study found that ehd2 is a tumor suppressor gene of breast cancer, which site-directed mutagenesis is closely related to the patient's overall survival and disease-free survival. By using the integrated analysis method of mRNA and miRNA micro

英文关键词： breast cancer；ehd2；bioinformatics；microarray；regulatory network