用RNA-Seq新技术筛选和鉴定与荔枝落果相关的基因

项目名称： 用RNA-Seq新技术筛选和鉴定与荔枝落果相关的基因

项目编号： No.31171920

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 农业科学

项目作者： 李建国

作者单位： 华南农业大学

项目金额： 46万元

中文摘要： 该项目以华南特色果树荔枝为对象，落果是其生产中亟待解决的一个"瓶颈"问题，果实脱落与调控的分子机理也是当今果实发育领域研究的一个热点问题。该项目在科学严谨的田间试验设计（植物生长调节剂延迟和促进落果处理，碳水化合物盈亏延迟和促进落果处理）基础上，获取有显著生物效应的果柄离区材料，通过新一代高通量转录组测序技术（RNA-Seq），首先对不同处理下的混合样品进行深度转录组测序，获得与荔枝果实脱落相关转录组文库（参考序列）；其次分别对不同处理下的样品进行单独RNA-seq，获得不同处理下差异表达基因库；再通过求不同处理下差异表达基因库交集的方法获得受激素和碳水化合物共同诱导的与荔枝脱落相关的差异表达基因库；最后通过高级生物信息学方法和RT-qPCR技术对这些差异基因进行分析和鉴定。因此，本项目的立项既谋求了学术上的新意和深度，在果实发育领域具前瞻性，也能为解决生产中落果问题提供理论依据和技术方法

中文关键词： 荔枝；落果；转录组测序；基因；

英文摘要：

英文关键词： litchi；fruit-abscission；RNA-seq；gene；