超级增强子及其关联主转录因子影响胚胎干细胞分化倾向性的研究

项目名称： 超级增强子及其关联主转录因子影响胚胎干细胞分化倾向性的研究

项目编号： No.31401259

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 生物科学

项目作者： 张曦

作者单位： 深圳华大基因研究院

项目金额： 24万元

中文摘要： 多能干细胞分化倾向性的差异阻碍高效稳定体外分化系统的建立，影响干细胞在转化医学研究中的应用。近期研究表明主转录因子在细胞命运决定中起重要作用，依据其在染色质上的结合位点密度定义了超级增强子概念，超级增强子驱动能定义细胞身份相关基因的表达。目前多数细胞类型的主转录因子未知，可用H3K27ac表观修饰作为定义超级增强子的替代物。本项目我们将结合自主和定向分化确定不同胚胎干细胞系向外、中和内三胚层分化效率的差异，利用染色质免疫共沉淀测序技术和RNA-seq研究分化过程中H3K27ac表观修饰和基因表达的变化，分析各胚胎及胚层细胞系特异的超级增强子及关联基因，阐明备选主转录因子和胚胎干细胞定向分化差异的相关性；同时对备选主转录因子利用CRISPR-Cas9体系进行功能分析，逆向寻找决定三胚层状态的主转录因子，建立高效稳定的主转录因子功能分析平台，为其他细胞类型主转录因子发现和功能分析奠定好的基础。

中文关键词： 分化倾向性；超级增强子；差异表达基因；定向分化；

英文摘要： The development of robust and stable in vitro differentiation protocols has been hindered by the functional variability of pluripotent stem cells, which further has an impact on stem cells application in translational medicine research. Several studies ha

英文关键词： Differentiation propensity；Super-enhancer；Deferentially expressed genes；Direct differentiation；