项目名称: 基于拷贝数变异识别抑癌的miRNA与转录因子及其协同纠错机制的研究
项目编号: No.81372492
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2013
项目学科: 医药、卫生
项目作者: 许艳
作者单位: 哈尔滨医科大学
项目金额: 72万元
中文摘要: 拷贝数变异(CNV)广泛存在基因组中并通过剂量效应影响基因表达,进而导致癌症的发生和发展。整合CNV与基因表达的研究,有助于从癌症众多的分子变化中识别出处于驱动地位的driver基因。然而,一些基因在正常组织和癌组织都发生CNV,但表型效应却截然不同。目前导致此现象的潜在机制尚不明确。我们的预实验发现,正常人群中的CNV区域比癌相关的和非CNV区域显著更多地受到miRNA和TF的靶向。据此,提出"人体内存在抑癌的平衡子miRNA与TF协同纠错系统"的假设,推测miRNA和TF共调控通路的失调是引发癌症的原因之一。本项目拟整合CNV、基因表达及转录调控等多组学信息,构建三维调控网络,开发研究抑癌机制的新框架,识别乳腺癌的抑癌平衡子miRNA与TF及其协同调控通路,并推广研究其他癌症,建立综合分析平台,阐明调控CNV基因转录过程的机制及其对癌症的影响,为有效防治癌症及抗癌药物的研发提供新线索。
中文关键词: 癌症;拷贝数变异;剂量效应;调控模块;非编码RNA
英文摘要: Copy number variations (CNVs) which are pervasive in human genome, influence gene expression through dosage effects, which would cause the occurrence and development of cancers. Integrating CNVs and gene expression will go far towards distinguishing the d
英文关键词: cancer;copy number alteration;dosage effect;regulatory motif;ncRNA