项目名称: 牙菌斑生物膜相容性基因的筛选
项目编号: No.30973317
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2010
项目学科: 医药、卫生
项目作者: 魏世成
作者单位: 北京大学
项目金额: 30万元
中文摘要: 牙菌斑是一种典型的生物膜,其内存在正常菌群,细菌之间的相互作用决定牙菌斑生物膜内定植的细菌种类。细菌之间通过协同利用生态位点、营养物质、合成共生因子及信息分子等共存于牙菌斑生物膜内,相关的基因为牙菌斑生物膜相容性基因。尽管已筛选出一些参与牙菌斑生物膜形成的基因,但都是针对单菌种进行的研究,需从牙菌斑宏基因组的角度,对多菌种构成的生物膜进行全面、系统的研究。首先构建牙菌斑总基因组fosmid文库,将文库加至牙菌斑菌群中,分离出能与菌群共生于生物膜内、携带fosmid的E.coli,在筛选出的fosmid中可能含有牙菌斑生物膜相容性基因。随后将筛出的基因插入表达质粒,转化E.coli,通过体外生物膜形成实验以及动物实验,验证基因的相容性,即基因编码的蛋白使非牙菌斑固有菌E.coli能相容于牙菌斑菌群,共生在有限的生态位点,形成牙菌斑生物膜。将为理解牙菌斑内正常菌群的形成、细菌之间的相互作用。
中文关键词: 牙菌斑;宏基因组学;Fosmid文库;宏基因组测序;口腔微生物
英文摘要:
英文关键词: Dental plaque;Metagenomics;Fosmid library;Metagenomic sequencing;Oral microbiome