X伴性遗传病印记效应检测及其关联分析的统计方法研究

项目名称： X伴性遗传病印记效应检测及其关联分析的统计方法研究

项目编号： No.81373098

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 医药、卫生

项目作者： 周基元

作者单位： 南方医科大学

项目金额： 65万元

中文摘要： 很多遗传病跟X连锁突变基因相关联，虽然已有一些方法定位X染色体上的致病基因，但较之常染色体上的研究却滞后很多，始终存在以下未解决的重要且现实的问题：当Hardy-Weinberg平衡律（HWE）不成立时如何估计X染色体上的基因频率？遗传印记是一种非孟德尔遗传现象，在关联分析中忽略其影响就会导致疾病位点的定位不精确，甚者导致错误结果，那么在X染色体上如何检测印记效应？如何将印记效应的信息合并到关联分析之中以提高其检验效能？如何使遗传统计中Monte Carlo方法的运算速度更快和偏差更小？因此，本项目针对X染色体，将建立HWE不成立时基因频率的估计方法及HWE的似然比检验方法；建立印记效应的检测方法及定位印记基因的关联分析方法；提出一种基于重复抽样的运算速度更快、偏差与均方根误更小的Monte Carlo方法，以期攻克上述难题，为X伴性遗传病研究中定位疾病位点提供理论支持和实用统计分析工具。

中文关键词： X伴性遗传病；印记效应；关联分析；等位基因频率；重复抽样方法

英文摘要： It was reported that many complex traits are associated with X-linked genetic variants in the literature. Currently, there have been several methods to map the disease alleles on the X chromosome. However, development of methods for detecting association

英文关键词： X-linked disease；imprinting effects；association analysis；allele frequency；resampling-based method