项目名称: 计算酶设计中活性位点序列选择全局优化算法研究

项目编号: No.20976093

项目类型: 面上项目

立项/批准年度: 2010

项目学科: 数理科学和化学

项目作者: 朱玉山

作者单位: 清华大学

项目金额: 30万元

中文摘要: 计算酶设计是计算机辅助化学产品设计的重要研究内容,是传统的化工系统工程与现代生物化工相结合的研究范例。本申请探索在数学规划建模的基础上建立计算酶设计问题的混合整数非线性规划模型,通过分析这个模型的特殊数学结构克服模型中非凸带来的优化困难,核心是开发计算酶设计中活性位点序列选择的全局优化算法,从而确定性的找到对应于全局能量最低构象的氨基酸序列。在计算酶设计全局优化算法的基础上,本申请进一步探索酶活性位点序列选择的物理化学规律,研究通过计算设计提高酶活性的可行性方法。本申请预期将研究的计算酶设计的序列选择模型及全局优化算法应用到CPC酰化酶的活性位点设计中,为开发一步酶法制备药物中间体7-ACA打下基础。

中文关键词: 计算酶设计;蛋白-配体结合;全局优化;混合整数线性规划;生物催化剂设计

英文摘要:

英文关键词: computational enzyme design;protein-ligand binding;global optimization;mixed-integer linear programmi;biocatalyst design

成为VIP会员查看完整内容
0

相关内容

【经典书】全局优化算法:理论与应用,820页pdf
专知会员服务
154+阅读 · 2021年11月10日
【干货书】机器学习算法视角,249页pdf
专知会员服务
142+阅读 · 2021年10月18日
专知会员服务
33+阅读 · 2021年8月16日
专知会员服务
18+阅读 · 2021年6月29日
【干货书】机器学习Primer,122页pdf
专知会员服务
106+阅读 · 2020年10月5日
【经典书】机器学习:贝叶斯和优化方法,1075页pdf
专知会员服务
404+阅读 · 2020年6月8日
使用深度学习,通过一个片段修饰进行分子优化
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
Convex-Concave Min-Max Stackelberg Games
Arxiv
0+阅读 · 2022年4月19日
Arxiv
15+阅读 · 2020年2月6日
Deep Reinforcement Learning: An Overview
Arxiv
17+阅读 · 2018年11月26日
Arxiv
26+阅读 · 2018年8月19日
小贴士
相关主题
相关VIP内容
【经典书】全局优化算法:理论与应用,820页pdf
专知会员服务
154+阅读 · 2021年11月10日
【干货书】机器学习算法视角,249页pdf
专知会员服务
142+阅读 · 2021年10月18日
专知会员服务
33+阅读 · 2021年8月16日
专知会员服务
18+阅读 · 2021年6月29日
【干货书】机器学习Primer,122页pdf
专知会员服务
106+阅读 · 2020年10月5日
【经典书】机器学习:贝叶斯和优化方法,1075页pdf
专知会员服务
404+阅读 · 2020年6月8日
相关基金
国家自然科学基金
1+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
3+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
微信扫码咨询专知VIP会员