全基因组关联作图结合转录组分析发掘长豇豆耐热/旱候选基因

项目名称： 全基因组关联作图结合转录组分析发掘长豇豆耐热/旱候选基因

项目编号： No.30900985

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 金属学与金属工艺

项目作者： 徐沛

作者单位： 浙江省农业科学院

项目金额： 20万元

中文摘要： 热/旱胁迫引起长豇豆大量落花落荚，产量和品质下降。本项目在鉴定我国主要长豇豆种质耐热/旱性的基础上，利用与美国加州大学合作的cSNP分析平台，从全基因组水平检测96份代表性材料1536个cSNP位点的基因型；通过对标记连锁不平衡的分析揭示长豇豆基因组的连锁不平衡特征；通过基因型与耐热/旱表型关联分析，鉴定与耐热/旱性显著关联的cSNP位点。同时，利用普通豇豆EST序列设计引物进行PCR扩增，创制首张豇豆基因芯片，在耐与不耐热/旱长豇豆种质间比较鉴定热/旱胁迫响应基因，勾绘与耐热/旱性相关的主要或特异代谢途径。在此基础上，利用豇豆-模式豆类比较基因组分析这一桥梁，在关联作图鉴定的显著性位点附近进一步精细分析、寻找与已鉴定的耐热/旱代谢途径有关的基因，确定出耐热/旱候选基因。研究结果对了解长豇豆连锁不平衡特征、发掘育种目标基因及其等位变异有重要意义，也是下一步开展候选基因功能分析的基础。

中文关键词： 豇豆；耐旱性；关联分析；转录组；连锁不平衡

英文摘要：

英文关键词： cowpea；drought tolerance；association mapping；transcriptome；linkage disequilibrium