项目名称: 全基因组关联分析结合转录组测序发掘茄子黄萎病抗性QTL
项目编号: No.31171954
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2012
项目学科: 植物保护学、园艺学与植物营养学
项目作者: 杨旭
作者单位: 扬州大学
项目金额: 56万元
中文摘要: 黄萎病是威胁茄子生产最严重的病害之一。由于目前茄子高抗黄萎病的基因只存在于野生种质中,而高抗黄萎病的野生种与高感黄萎病的栽培种之间的杂交存在不亲和或杂种不育等问题,故基于双亲分离群体的QTL连锁分析难以实现,严重制约了茄子黄萎病抗性QTL的研究。以连锁不平衡分析为基础的全基因组关联分析和新一代高通量测序为茄子抗黄萎病QTL的研究提供了新的手段。本项目将利用全基因组关联分析结合转录组测序发掘茄子抗黄萎病QTL。通过高抗、高感材料转录组测序开发抗感差异标记;采用遗传图谱上的SSR等标记及抗感差异标记对190份茄子代表性材料进行基因型鉴定;在考虑群体结构条件下,通过表型与基因型的关联分析,鉴定茄子黄萎病抗性QTL,获得显著性关联标记;利用差异表达基因结合鉴定的关联标记获得抗黄萎病候选基因。研究结果将深入揭示茄子连锁不平衡结构特征,为开展茄子黄萎病抗性QTL精细定位、分子标记辅助育种奠定重要基础。
中文关键词: 茄子;黄萎病;QTL;关联分析;转录组测序
英文摘要:
英文关键词: Eggplant;Verticillium Wilt;QTL;association analysisn;transcriptome sequencing