Multiscale dynamical systems, modeled by high-dimensional stiff ordinary differential equations (ODEs) with wide-ranging characteristic timescales, arise across diverse fields of science and engineering, but their numerical solvers often encounter severe efficiency bottlenecks. This paper introduces a novel DeePODE method, which consists of an Evolutionary Monte Carlo Sampling method (EMCS) and an efficient end-to-end deep neural network (DNN) to predict multiscale dynamical systems. We validate this finding across dynamical systems from ecological systems to reactive flows, including a predator-prey model, a power system oscillation, a battery electrolyte thermal runaway, and turbulent reaction-diffusion systems with complex chemical kinetics. The method demonstrates robust generalization capabilities, allowing pre-trained DNN models to accurately predict the behavior in previously unseen scenarios, largely due to the delicately constructed dataset. While theoretical guarantees remain to be established, empirical evidence shows that DeePODE achieves the accuracy of implicit numerical schemes while maintaining the computational efficiency of explicit schemes. This work underscores the crucial relationship between training data distribution and neural network generalization performance. This work demonstrates the potential of deep learning approaches in modeling complex dynamical systems across scientific and engineering domains.


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