Identifying predictive factors via multivariable statistical analysis is for rare diseases often impossible because the data sets available are too small. Combining data from different medical centers into a single (larger) database would alleviate this problem, but is in practice challenging due to regulatory and logistic problems. Federated Learning (FL) is a machine learning approach that aims to construct from local inferences in separate data centers what would have been inferred had the data sets been merged. It seeks to harvest the statistical power of larger data sets without actually creating them. The FL strategy is not always feasible for small data sets. Therefore, in this paper we refine and implement an alternative Bayesian Federated Inference (BFI) framework for multi center data with the same aim as FL. The BFI framework is designed to cope with small data sets by inferring locally not only the optimal parameter values, but also additional features of the posterior parameter distribution, capturing information beyond that is used in FL. BFI has the additional benefit that a single inference cycle across the centers is sufficient, whereas FL needs multiple cycles. We quantify the performance of the proposed methodology on simulated and real life data.


翻译:通过多变量统计分析确定预测因素对于罕见疾病来说往往是不可能的,因为现有的数据集太小。将不同医疗中心的数据合并成一个单一(大)数据库可以缓解这一问题,但实际上由于监管和后勤问题而具有挑战性。联邦学习(FL)是一种机器学习方法,目的是在单独的数据中心从地方推论中得出如果将数据集合并,将会推断出哪些因素。它试图获取较大数据集的统计能力,而不会实际生成这些数据集。FL战略对于小数据集并不总是可行。因此,在本文件中,我们改进并采用与FL相同的多中心数据的替代巴伊西亚联邦推断框架。BFI框架旨在应对小数据集,不仅从当地推断最佳参数值,而且从外表参数分布的额外特征中推断出哪些因素,从而捕捉到超出FL所用范围的信息。BFI具有额外好处,即整个中心单一推论周期已经足够,而FL需要多个周期。我们量化了模拟和实际生命数据的拟议方法的绩效。

0
下载
关闭预览

相关内容

不可错过!《机器学习100讲》课程,UBC Mark Schmidt讲授
专知会员服务
73+阅读 · 2022年6月28日
因果图,Causal Graphs,52页ppt
专知会员服务
246+阅读 · 2020年4月19日
专知会员服务
161+阅读 · 2020年1月16日
强化学习最新教程,17页pdf
专知会员服务
174+阅读 · 2019年10月11日
【哈佛大学商学院课程Fall 2019】机器学习可解释性
专知会员服务
103+阅读 · 2019年10月9日
【SIGGRAPH2019】TensorFlow 2.0深度学习计算机图形学应用
专知会员服务
39+阅读 · 2019年10月9日
VCIP 2022 Call for Demos
CCF多媒体专委会
1+阅读 · 2022年6月6日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
26+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
28+阅读 · 2019年5月18日
逆强化学习-学习人先验的动机
CreateAMind
15+阅读 · 2019年1月18日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
17+阅读 · 2019年1月7日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
42+阅读 · 2019年1月3日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
17+阅读 · 2018年12月24日
【论文】变分推断(Variational inference)的总结
机器学习研究会
39+阅读 · 2017年11月16日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2008年12月31日
Arxiv
10+阅读 · 2021年11月3日
Arxiv
10+阅读 · 2021年3月30日
Arxiv
14+阅读 · 2020年12月17日
VIP会员
相关VIP内容
不可错过!《机器学习100讲》课程,UBC Mark Schmidt讲授
专知会员服务
73+阅读 · 2022年6月28日
因果图,Causal Graphs,52页ppt
专知会员服务
246+阅读 · 2020年4月19日
专知会员服务
161+阅读 · 2020年1月16日
强化学习最新教程,17页pdf
专知会员服务
174+阅读 · 2019年10月11日
【哈佛大学商学院课程Fall 2019】机器学习可解释性
专知会员服务
103+阅读 · 2019年10月9日
【SIGGRAPH2019】TensorFlow 2.0深度学习计算机图形学应用
专知会员服务
39+阅读 · 2019年10月9日
相关资讯
VCIP 2022 Call for Demos
CCF多媒体专委会
1+阅读 · 2022年6月6日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
26+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
28+阅读 · 2019年5月18日
逆强化学习-学习人先验的动机
CreateAMind
15+阅读 · 2019年1月18日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
17+阅读 · 2019年1月7日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
42+阅读 · 2019年1月3日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
17+阅读 · 2018年12月24日
【论文】变分推断(Variational inference)的总结
机器学习研究会
39+阅读 · 2017年11月16日
相关基金
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2008年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员