Generated synthetic data in medical research can substitute privacy and security-sensitive data with a large-scale curated dataset, reducing data collection and annotation costs. As part of this effort, we propose UniXGen, a unified chest X-ray and report generation model, with the following contributions. First, we design a unified model for bidirectional chest X-ray and report generation by adopting a vector quantization method to discretize chest X-rays into discrete visual tokens and formulating both tasks as sequence generation tasks. Second, we introduce several special tokens to generate chest X-rays with specific views that can be useful when the desired views are unavailable. Furthermore, UniXGen can flexibly take various inputs from single to multiple views to take advantage of the additional findings available in other X-ray views. We adopt an efficient transformer for computational and memory efficiency to handle the long-range input sequence of multi-view chest X-rays with high resolution and long paragraph reports. In extensive experiments, we show that our unified model has a synergistic effect on both generation tasks, as opposed to training only the task-specific models. We also find that view-specific special tokens can distinguish between different views and properly generate specific views even if they do not exist in the dataset, and utilizing multi-view chest X-rays can faithfully capture the abnormal findings in the additional X-rays. The source code is publicly available at: https://github.com/ttumyche/UniXGen.


翻译:医学研究中生成的合成数据可以取代隐私和安全敏感数据,以大规模整理数据集取代隐私和安全敏感数据,减少数据收集和批注费用。作为这一努力的一部分,我们建议UnXGen,一个统一的胸前X光和报告的生成模型,并作出以下贡献。首先,我们设计一个双向胸X光和报告的生成统一模型,采用矢量量化方法,将胸X光分解成离散的视觉符号,并将这两项任务作为序列生成任务。第二,我们推出若干特殊标志,以生成带有特定观点的胸X光片,在没有理想观点时,这些观点是有用的。此外,UnXGen可以灵活地从一个角度到多个角度提供各种投入,以利用其他X光视图中的额外发现。我们采用了高效的计算和记忆效率变压器,以高分辨率和长段落报告方式处理多视X光胸透的远程输入序列。在广泛的实验中,我们展示了我们的统一模型对两组生成任务具有协同效应,而不是培训任务特定模型。我们还发现,在特定模型中,我们还可以正确区分特定图像。</s>

0
下载
关闭预览

相关内容

ACM/IEEE第23届模型驱动工程语言和系统国际会议,是模型驱动软件和系统工程的首要会议系列,由ACM-SIGSOFT和IEEE-TCSE支持组织。自1998年以来,模型涵盖了建模的各个方面,从语言和方法到工具和应用程序。模特的参加者来自不同的背景,包括研究人员、学者、工程师和工业专业人士。MODELS 2019是一个论坛,参与者可以围绕建模和模型驱动的软件和系统交流前沿研究成果和创新实践经验。今年的版本将为建模社区提供进一步推进建模基础的机会,并在网络物理系统、嵌入式系统、社会技术系统、云计算、大数据、机器学习、安全、开源等新兴领域提出建模的创新应用以及可持续性。 官网链接:http://www.modelsconference.org/
专知会员服务
60+阅读 · 2020年3月19日
100+篇《自监督学习(Self-Supervised Learning)》论文最新合集
专知会员服务
164+阅读 · 2020年3月18日
专知会员服务
161+阅读 · 2020年1月16日
[综述]深度学习下的场景文本检测与识别
专知会员服务
77+阅读 · 2019年10月10日
【哈佛大学商学院课程Fall 2019】机器学习可解释性
专知会员服务
103+阅读 · 2019年10月9日
【SIGGRAPH2019】TensorFlow 2.0深度学习计算机图形学应用
专知会员服务
39+阅读 · 2019年10月9日
VCIP 2022 Call for Demos
CCF多媒体专委会
1+阅读 · 2022年6月6日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
26+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
28+阅读 · 2019年5月18日
逆强化学习-学习人先验的动机
CreateAMind
15+阅读 · 2019年1月18日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
17+阅读 · 2019年1月7日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
42+阅读 · 2019年1月3日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
17+阅读 · 2018年12月24日
【论文】图上的表示学习综述
机器学习研究会
14+阅读 · 2017年9月24日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
Arxiv
13+阅读 · 2022年10月27日
Arxiv
126+阅读 · 2020年9月6日
Arxiv
12+阅读 · 2020年8月3日
Meta-Learning to Cluster
Arxiv
17+阅读 · 2019年10月30日
Learning Implicit Fields for Generative Shape Modeling
Arxiv
10+阅读 · 2018年12月6日
Arxiv
19+阅读 · 2018年3月28日
VIP会员
相关资讯
VCIP 2022 Call for Demos
CCF多媒体专委会
1+阅读 · 2022年6月6日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
26+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
28+阅读 · 2019年5月18日
逆强化学习-学习人先验的动机
CreateAMind
15+阅读 · 2019年1月18日
强化学习的Unsupervised Meta-Learning
CreateAMind
17+阅读 · 2019年1月7日
Unsupervised Learning via Meta-Learning
CreateAMind
42+阅读 · 2019年1月3日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
17+阅读 · 2018年12月24日
【论文】图上的表示学习综述
机器学习研究会
14+阅读 · 2017年9月24日
相关基金
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
1+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员