植物ta-siRNA的批量辨识和其作用通路挖掘

项目名称： 植物ta-siRNA的批量辨识和其作用通路挖掘

项目编号： No.31171273

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 生物科学

项目作者： 张长青

作者单位： 金陵科技学院

项目金额： 56万元

中文摘要： ta-siRNAs(trans-acting small interfering RNAs)是miRNA切割靶基因后的功能产物，参与调控植物生长发育的阶段转换、疾病抵抗和逆境适应等重要生理过程。目前，由于ta-siRNAs和其作用通路的批量辨识准确性不高而限制了其功能研究。 本项目将以解决ta-siRNA计算辨识中的假阳性问题为切入点，(1)通过构建ta-siRNAs辨识新模型和引入新一代测序技术产生的RNA降解库序列，开发计算和实验相结合的"ta-siRNAs及其作用通路"辨识的新工具；(2)利用新工具全面挖掘模式植物中的ta-siRNAs和其作用通路；(3)引入模式植物在突变或逆境胁迫条件下获得的小RNA测序结果，注释从基因到表型的ta-siRNA调控网络，刻画ta-siRNAs参与的调控新通路，扩充人类关于植物生长发育调控网络的新认知。

中文关键词： ta-siRNA；miRNA；非编码RNA；TAS；

英文摘要：

英文关键词： ta-siRNA；miRNA；non-coding RNA；TAS；