项目名称: 基于元胞自动机图的蛋白质序列离散灰色模型及其在药物设计中的应用研究

项目编号: No.60961003

项目类型: 地区科学基金项目

立项/批准年度: 2010

项目学科: 金属学与金属工艺

项目作者: 肖绚

作者单位: 景德镇陶瓷学院

项目金额: 18万元

中文摘要: 项目基于蛋白质元胞自动机图和灰色理论,研究蛋白质序列离散灰色模型的构建及其在药物设计中的应用。蛋白质元胞自动机图(CAI)将蛋白质序列转换成二维图像,能将许多隐含在长而复杂的生物序列中的特征表现出来。从CAI中得出的参数作为蛋白质伪氨基酸成分能很好描述的蛋白质序列整体特征。在此基础上建立精确性分析框架下的蛋白质序列扰动"放大"平台,建立蛋白质序列离散灰色模型。本项目设计一种新的基于改进的灰关联度模式识别方法,研究蛋白质序列自动分类技术,挖掘蛋白质序列特征以及不同特征与蛋白质结构和功能之间的关系,提出多序列之间的灰色关联度检验准则,了解蛋白质特征序列的家族特性和进化特征。 项目还将基于此模型研究与药物设计相关的蛋白质结构与功能预测模型,如:GPCR结构类型预测、蛋白质-蛋白质结合位点预测、蛋白质四维结构预测等。这种概念模型对指导新药设计具有应用前景。

中文关键词: 元胞自动机图;蛋白质序列;离散灰色模型;结构功能预测;

英文摘要:

英文关键词: cellular automata image;protein sequence;grey dynamic model;predicting the function and st;

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