病毒性肝炎恶性转化的多元调控网络研究

项目名称： 病毒性肝炎恶性转化的多元调控网络研究

项目编号： No.91229120

项目类型： 重大研究计划

立项/批准年度： 2013

项目学科： 肿瘤学1

项目作者： 赵屹

作者单位： 中国科学院计算技术研究所

项目金额： 90万元

中文摘要： 病毒性肝炎所致的炎性反应及炎性环境对肝细胞癌的发生、发展有着重要的作用。然而，目前对于病毒性肝炎诱导肝细胞癌变的机制尚不清楚。因此，研究炎性细胞与肝/肝癌细胞间的调控网络对于揭示慢性炎症向肝细胞癌转化的机制有着重要的意义。本研究应用病毒性肝炎引发肝细胞癌过程中各阶段临床样本，综合运用小RNA、mRNA及长非编码RNA高通量测序技术、芯片检测、生物信息学分析、系统生物学及分子生物学等手段，通过实时监测炎症恶性转化过程各阶段淋巴细胞、巨噬细胞及肝/肝癌细胞中各类分子的动态变化，分别构建含有小RNA、mRNA、长非编码RNA及多种调控模式的多元调控网络。通过对三类多元调控网络中拓扑结构、功能模块分析，利用网络模块比对算法，找到炎症恶性转化过程中淋巴细胞、巨噬细胞与肝细胞癌变之间起关键作用的功能模块，找出其中关键因子，并针对关键节点进行动物水平的实验干预性治疗以证实其在未来临床诊断及治疗上的意义。

中文关键词： 肝细胞癌；调控网络；高通量测序；长非编码RNA；

英文摘要： Inflammatory responses and microenvironment induced by persistent viral hepatitis play important roles at different stages of hepatocellular carcinoma (HCC) development, including initiation, promotion, invasion, and metastasis. However, the molecular pathogenesis of this process is not fully understood. Thus, it is necessary to explore the regulatory network between inflammatory cells and hepatocytes/HCC cells. In this study, we will take advantage of small RNA and polyA +/- RNA sequencing technologies, microarray analysis, bioinformatics, systems biology, and molecular biology in the clinical samples representative of different stages of malignant transformation. Through real-time monitoring the dynamic changes of various molecules in lymphocytes, macrophages and hepatocytes/HCC cells during this process, we will construct a multivariant regulatory network for each type of cells. After analyzing the topological properties and functional modules, we aim to find the key modules and molecules among the three networks by using a network-comparing algorithm, and validate their significance in future clinical diagnosis and treatment by conducting experimental intervention treatment on animal models.

英文关键词： hepatocellular carcinoma；regulatory network；Next generation sequencing；long noncoding RNA；