水稻苗期耐盐基因qSTS8的精细定位与候选基因分析

项目名称： 水稻苗期耐盐基因qSTS8的精细定位与候选基因分析

项目编号： No.31401361

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 农业科学

项目作者： 田蕾

作者单位： 宁夏大学

项目金额： 25万元

中文摘要： 土壤盐渍化是危害水稻生产的重要非生物胁迫之一。宁夏土壤盐渍化非常严重，水稻生产受其影响极为明显。申请人利用耐盐品种“法国稻”和盐敏感品种“日本晴”杂交获得的F2群体在水稻8号染色体定位了1个新的耐盐相关主效QTL qSTS8，贡献率22%。本项目拟利用耐盐F3家系与日本晴连续回交，结合分子标记辅助选择获得BC3F2群体，采用染色体代换定位策略，对该位点进行精细定位。利用转录组测序分析盐胁迫和正常生长条件下日本晴和耐盐近等基因系NIL（FSTS8）的全基因组表达谱，筛选差异表达基因、鉴定基因区SNP差异。将精细定位区间与基因组表达谱和SNP信息整合，筛选耐盐候选基因。系统测定水稻种质资源耐盐候选基因序列，利用关联分析方法，确定功能性突变位点，发掘具有潜在利用价值的有利等位基因。本项目研究结果不仅为水稻耐盐分子机理研究提供重要参考，而且为利用分子育种途径提高水稻品种耐盐性提供理论支持。

中文关键词： 水稻(Oryza sativa L.)；耐盐性；精细定位；候选基因分析；转录组测序

英文摘要： Soil salinity is a major abiotic stress harmful to rice production. As a common phenomenon in Ningxia, salinization has caused soil degradation and a prominent reduction of rice yield. In our previous study, an F2 population derived from a cross between a

英文关键词： Rice；Salt tolerance；Fine-mapping；candidate gene analysis；RNA sequencing