综合精细定位和选择性清扫策略鉴定猪SSC1上候选区域的脂肪沉积QTN

项目名称： 综合精细定位和选择性清扫策略鉴定猪SSC1上候选区域的脂肪沉积QTN

项目编号： No.31172192

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 畜牧学与草地科学、兽医学、水产学

项目作者： 樊斌

作者单位： 华中农业大学

项目金额： 63万元

中文摘要： 搜寻并鉴定出重要经济性状QTN是当前猪基因组学研究主旨之一。基于申请人新近完成的全基因组关联和MC4R基因重测序研究结果，本项目拟在猪1号染色体165.47-168.63Mb区域展开精细定位，以识别脂肪沉积候选基因和QTN。在目标区域内重测序挖掘新SNPs，制备Sequenom芯片并在多个不同试验设计猪群中分型。在具明确系谱和背膘厚记录的大白猪全同胞/半同胞家系进行同源相同（IBD）定位，鉴别出携带有利"QTL"等位基因的最短IBD片段。利用巴克夏×夏、大白×猪F2资源群体，在目标区域开展连锁不平衡-连锁（LDLA）定位分析。在多个地方和引入猪品种中实施选择性清扫分析，寻找经受选择基因组区域。综合结果选取候选基因和致因突变，采用适宜功能基因组学方法做生物学功能验证，藉此确定QTN并初步揭示其调控机理。本项目为猪脂肪沉积的分子调控机理研究增添新内容，并为猪产肉性状辅助选择提供新标记。

中文关键词： 全基因组关联分析；MC4R；选择性清扫；脂肪沉积；FarmCPU

英文摘要：

英文关键词： GWAS；MC4R；Selective Sweep；Fat deposit；FarmCPU