利用关联分析方法挖掘香菇重要性状相关标记及基因

项目名称： 利用关联分析方法挖掘香菇重要性状相关标记及基因

项目编号： No.31372117

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 农业科学

项目作者： 肖扬

作者单位： 华中农业大学

项目金额： 78万元

中文摘要： 基于连锁不平衡的关联分析已成为作物遗传学与基因组学的研究热点。本课题以具有丰富遗传多样性的100个香菇野生菌株和80个栽培菌株为研究群体，基于基因组测序和连锁分析的结果，开发、筛选全基因组范围内的SSR、InDel、SNP标记及候选基因特异性的标记，分析群体内各菌株的分子标记基因型，继而通过香菇群体的栽培试验，测定其重要农艺性状的表型数据，再结合表型与基因型数据，开展基于全基因组和候选基因的关联分析，寻找与目标性状关联标记位点的优异等位变异及其载体菌株材料，开发性状相关标记用于分子标记辅助育种。本项目首次将关联分析引入到香菇数量遗传研究领域，将为充分挖掘我国丰富香菇种质资源中蕴含的优异等位基因，促进我国香菇分子标记辅助育种研究奠定重要基础，对在其它大型真菌中开展类似研究亦具有重要的借鉴意义。

中文关键词： 香菇；数量性状；分子标记；关联分析；候选基因

英文摘要： Association analysis on the basis of linkage disquilibrium has become a research focus in crop genetics and genomics. 100 wild strains and 80 cultivated strains of Lentinula edodes that possess abundant genetic diversity are employed as research populatio

英文关键词： Lentinula edodes；Quantitative trait；Molecular marker；Association analysis；Candidate genes