酵母蛋白质相互作用网络的动态性质研究

项目名称： 酵母蛋白质相互作用网络的动态性质研究

项目编号： No.30800200

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2009

项目学科： 生物科学

项目作者： 李栋

作者单位： 中国人民解放军军事医学科学院

项目金额： 16万元

中文摘要： 蛋白质相互作用在很多生物学进程中发挥重要作用，对蛋白质相互作用网络的分析有助于从整体上理解细胞的生物学功能。当前对蛋白质网络的研究大都基于静态的网络，而生命是一个动态的体系，静态网络并不能反映蛋白质活性和蛋白质相互作用对时空的依赖性。为更准确的理解生物学进程，有必要对蛋白网络的动态性质进行描述。本项目拟以酵母为研究对象，通过整合高可靠的酵母蛋白质相互作用数据和时间序列芯片表达数据，预测不同细胞条件和不同时刻活跃的蛋白质相互作用网络，并通过对静态和动态蛋白质网络的整体拓扑性质、高连接度蛋白质、网络模体和功能模块的分析和比较，揭示蛋白质相互作用网络的动态变化规律。同时，本项目还将通过对网络中功能模块动态性质的研究，初步探讨蛋白质复合体和信号转导通路的动态变化规律和调控机制。基于本项目的研究成果，本项目还将开发动态蛋白质相互作用网络分析平台，为用户提供在线访问。

中文关键词： 蛋白质相互作用网络；动态网络；信号转导通路；拓扑结构

英文摘要： Protein interactions play important roles in mose cellular process. Analyses of protein interaction networks are helpful to understall the overall biological function of cells. Life is a dynamic sytem, however, the current protein interaction networks can only describe the static system, and can't refelct the cellular activity and time- or spacial dependence of protein interactions. To better understand the biological process, it is necessary to analyze the dynamic properties of biological process. This project aims to reveal the active yeast protein interaction networks in different time/space by integrating high-confidence protein interaction and gene expression datasets, to analyze the dynamic rules of protein complex and signal pathways. The online web service will also be presented together with the studyies above.

英文关键词： Protein interaction network; dynamic network; signalling pathway; topology structure