项目名称: 代谢综合征相关因子SNP定位及其与环境因素的交互作用研究
项目编号: No.30972537
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2010
项目学科: 医药、卫生
项目作者: 刘艳
作者单位: 哈尔滨医科大学
项目金额: 31万元
中文摘要: 复杂疾病相关SNP位点与基因的识别是后基因组计划最大的挑战之一,基因与环境的交互作用研究已成为能否准确反映复杂生物系统遗传效应的关键。本课题在融合多种生物信息资源的基础上获取数据,拟采用统计学、系统生物学和生物信息学与计算机相结合的技术,识别并定位2型糖尿病和/或冠心病相关因子的SNP位点,建立随机森林和支持向量机模型;重点对两种疾病的相关位点在代谢综合征患者和对照中进行实际检测,利用所构建的统计模型进行分析,寻找并定位代谢综合征相关因子的SNP位点;通过对比三种疾病相关位点的差异,判定代谢综合征的相关基因和位点对糖尿病和/或冠心病的预测价值;引入信息论的交互作用原理,结合医学专业知识,利用实际数据和计算机模拟实验,研究基因-基因、SNP-SNP及基因-环境的交互作用,解决由于单个基因与疾病的弱关联而导致不同研究结果相互矛盾的现象,构建疾病发生的结构方程模型,探讨各因素的直接或间接效应。
中文关键词: 组学数据;复杂性疾病;模式识别;BP神经网络;结构方程模型
英文摘要:
英文关键词: Omics data;Complex diseases;Pattern recognition;BP neural networ;Structural equation model