人Th17细胞中染色质长距离相互作用的大规模鉴定及其对Th17细胞分化和相关免疫疾病调控功能的研究

项目名称： 人Th17细胞中染色质长距离相互作用的大规模鉴定及其对Th17细胞分化和相关免疫疾病调控功能的研究

项目编号： No.31401118

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 生物科学

项目作者： 李颖

作者单位： 中国科学院上海生命科学研究院

项目金额： 24万元

中文摘要： 作为与粘膜防御和多种免疫疾病相关的重要T细胞亚群，Th17分化中特异性基因的表达受多水平调控，其中启动子增强子间染色质长距离相互作用的调节尤为重要，很多疾病相关SNP位点也坐落在基因调控序列如增强子的位置，其调控的目标基因和致病机理并不清楚。本项目拟利用最新的ChIA-PET技术大规模鉴定Th17细胞特异的染色质长距离相互作用位点，阐释染色质高级结构对细胞分化的调控功能；并利用RNAi技术下调Th17细胞中RORγt等重要转录因子的表达，研究对染色质长距离相互作用、基因表达等的影响，从而阐释染色质高级结构对细胞分化的调控机制。另一方面，利用生物信息学方法筛选坐落在Th17特异增强子位置的免疫疾病相关SNP位点及其目标基因，从而理解免疫疾病相关SNP的致病机理及对Th17分化的调控功能。本项目不仅有助于阐释染色质高级结构对基因转录的调控功能，对深入理解免疫细胞分化机制和疾病防治也有重要帮助。

中文关键词： T 细胞分化；染色质三维结构；转录调控；HiC；

英文摘要： Th17 cell differentiation is a dynamic process in which expression of Th17 specific genes are regulated by the combination of transcription factors, epigenetic modification and higher order structures of chromatin, long-range promoter-enhancer chromatin i

英文关键词： T cell differentiation；3D genome organization；transcriptional regulation；HiC；