Regulatory authorities guide the use of permutation tests or randomization tests so as not to increase the type-I error rate when applying covariate-adaptive randomization in randomized clinical trials. For non-inferiority and equivalence trials, this paper derives adjusted confidence intervals using permutation and randomization methods, thus controlling the type-I error to be much closer to the pre-specified nominal significance level. We consider three variable types for the outcome of interest, namely normal, binary, and time-to-event variables for the adjusted confidence intervals. For normal variables, we show that the type-I error for the adjusted confidence interval holds the nominal significance level. However, we highlight a unique theoretical challenge for non-inferiority and equivalence trials: binary and time-to-event variables may not hold the nominal significance level when the model parameters are estimated by models that diverge from the data-generating model under the null hypothesis. To clarify these features, we present simulation results and evaluate the performance of the adjusted confidence intervals.


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